Një nga aktivitetet kryesore të Malteser Shqipëri është e lidhur me kujdesin shëndetësor. Ky aktivitet përfshin:
- Mbulimin e shërbimit mjekësor bazë në zonat e thella malore dhe popullsinë lokale, si: vizita mjekësore, terapi të nevojshme, analiza laboratorike, konsultime mjekësore të specializuara, transporte urgjente në spitale etj,
- Ndihmë mjekësore për komunitetin Rom dhe Egjiptian,
- Trajnime mbi edukimin shëndetësor për popullsinë lokale,
- Trajnimeve të Ndihmës së Parë për anëtarët e Malteser dhe anëtarët e disa organizatave të tjera të interesuara,
- Trajnimeve të Ndihmës së Parë për vullnetarët e Malteser,
- Trajnimeve të Ndihmës së Parë për policinë rrugore dhe forcat speciale të policisë në qytete të ndryshme,
- Trajnimeve të Ndihmës së Parë për nxënës të shkollave 9-vjeçare dhe të mesme sipas një marrëveshjeje të bërë me
- Ministrinë e Arsimit në Shqipëri.
- Trajnim në Edukimin Shëndetësor mbi kancerin e gjirit dhe të mitrës për gra dhe shpërndarje fletëpalosjesh.